Территориальный орган Росздравнадзора по Республике Марий Эл является территориальным органом Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения, осуществляет функции по контролю и надзору в сфере здравоохранения на территории Республики Марий Эл и действует в соответствии с Положением о Территориальном органе Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Республике Марий Эл, утвержденным приказом Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения от 06.10.2020 № 9150.
Территориальный орган Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития (Управление Росздравнадзора по Республике Марий Эл) создан на основании Приказа Минздравсоцразвития России от 22 ноября 2004 года № 205 (зарегистрирован в Минюсте РФ 17.12.2004г № 6198) и Приказа Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития от 20 декабря 2004 г. № 636-Пр/04.
22 декабря 2004 года выходит приказ Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития № 658 - Пр/04 "О местонахождении Управления Росздравнадзора по Республике Марий Эл", согласно которому Адрес: г. Йошкар-Ола, Ленинский проспект, д. 24а, 5 этаж, каб. 501 является местонахождением территориального органа Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения и социального развития по Респулике Марий Эл.
В связи с изданием Указа Президента Российской Федерации от 21.05.2012 № 636 "О структуре федеральных органов исполнительной власти", вступлением в силу постановления Правительства Российской Федерации от 19.06.2012 № 614 "О внесении изменений в постановление Правительства Российской Федерации от 30 июня 2004 г. №323" Федеральная служба по надзору в сфере здравоохранения и социального развития переименована в Федеральную службу по надзору в сфере здравоохранения.
В соответствии с приказом Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения от 06 июня 2013 года №2297-Пр/13 территориальный орган Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Республике Марий Эл (Управление Росздравнадзора по Республике Марий Эл) переименован в «территориальный орган Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения по Республике Марий Эл (территориальный орган Росздравнадзора по Республике Марий Эл).